Вся полнота верховной государственной власти, законодательной, исполнительной и судебной с середины XVI столетия сосредотачивается в руках царя. Все  действия органов власти совершаются от имени царя и по царскому указу. Свою власть царь осуществлял непосредственно через Боярскую Думу и Приказ тайных дел (с 1646 года).

     Функции государственного управления реализовывались через систему приказов - административно - судебных учреждений центрального и местного управления в Московском государстве. Становление приказов произошло в конце XV - начале XVI вв. Каждый приказ имел определенные функции, хотя четкого разграничения компетенций между ними не было. Многие приказы совмещали административные, судебные и финансовые функции. 

     Непосредственно Боярской Думе подчинялись Разрядный приказ, Поместный приказ и Посольский приказ. Этим трем приказам подчинялись все остальные приказы (кроме Дворцовых приказов и Патриарших приказов). Приказ Тайных дел подчинялся исключительно царю. Кроме того, царю и приказу Тайных дел подчинялись Дворцовые приказы. Свои приказы имел и Патриарх Московский и всея Руси, которые подчинялись только ему.

     Возглавляли приказы судьи из числа бояр, окольничьих, а также дьяков и думных дворян. Приказная система ликвидирована с образованием в первой четверти XVIII века коллегий в связи в проведением петровских "реформ".

Даты образования отдельных приказов

1535 год Разрядный приказ
1547 год Приказ Большого Дворца
1556 год Поместный приказ
1564 год Приказ Большого прихода
1567 год Ямской приказ
1571 год Челобитный приказ. Холопий приказ. Разбойный приказ
1573 год Постельный приказ
1579 год Земский приказ
1582 год Пушкарский приказ
1586 год Иноземский приказ
1599 год Конюшенный приказ. Казанский приказ
1601 год Стрелецкий приказ
1616 год Казачий приказ
1619 год Сыскной приказ
1620 год Аптекарский приказ
1621 год Приказ счетных дел
1628 год Приказ каменных дел
1634 год Приказ сбора ратных людей
1634 год  Приказ сбора даточных людей
1637 год Сибирский приказ
1646 год Приказ тайных дел
1649 год Монастырский приказ
1667 год Торговый приказ

Функции некоторых приказов
РАЗРЯДНЫЙ Вопросы личного состава армии. Назначение служащих государственного аппарата: воевод, наместников, послов. Руководство военными операциями.
ПОМЕСТНЫЙ Управление поместными и вотчинными землями центра Европейской России. Наделение дворян землей по решению Разрядного приказа.
ПОСОЛЬСКИЙ Международные вопросы.
ЯМСКОЙ Организация ямской гоньбы - государственной почтовой связи.
РАЗБОЙНЫЙ Вопросы разбойных и воровских дел (кроме Москвы)
ЗЕМСКИЙ Вопросы разбойных и воровских дел в Москве. Осуществление полицейских функций.
ЧЕЛОБИТНЫЙ Принятие прошений на царское имя. Осуществление судейских функций. Рассмотрение апелляций
СТРЕЛЕЦКИЙ Вопросы стрельцов-пехотинцев, проживавших в городских слободах
БРОННЫЙ. ПУШКАРСКИЙ Вопросы изготовления и хранения оружия.
ГОРОДОВОГО ДЕЛА Строительство городов на южных границах России.
СЧЕТНЫХ ДЕЛ Проверка доходов и расходов всех приказов.
КАМЕННЫХ ДЕЛ Осуществление казённого каменного строительства и заготовка строительных материалов для него.
БОЛЬШОГО ПРИХОДА Сбор на местах таможенных доходов. Наблюдение за мерами длины и веса.
НОВОЙ ЧЕТВЕРТИ Кабацкие сборы в Москве и южных городах. Борьба с незаконной продажей вина и табака.
БОЛЬШОЙ КАЗНЫ Вопросы казённой промышленности и торговли. Чеканка монеты.
АПТЕКАРСКИЙ Медицинские вопросы.
БОЛЬШОГО ДВОРЦА Управление дворцовым хозяйством в столице, дворцовыми волостями и селами по всей стране.
КАЗЁННЫЙ Хранение вещевой казны царя.
КОНЮШЕННЫЙ Наблюдение за царскими конюшнями и мастерскими, изготовлявшими кареты, сани, упряжь для царских выездов.
ЛОВЧИЙ Вопросы царской охоты.
СОКОЛЬНИЧИЙ Вопросы соколиной охоты.
ПОСТЕЛЬНЫЙ Вопросы царской спальни.